MetaboNetworks

A toolbox to interactively create, customize and explore multi-systemic metabolic reaction networks

Descargar
Descargar

Ahora está siguiendo esta publicación

Citar como

Joram Posma (2026). MetaboNetworks (https://es.mathworks.com/matlabcentral/fileexchange/42684-metabonetworks), MATLAB Central File Exchange. Recuperado .

Agradecimientos

Inspirado por: MatlabBGL

Categorías

Más información sobre Genomics and Next Generation Sequencing en Help Center y MATLAB Answers.

Información general

Compatibilidad con la versión de MATLAB

  • Compatible con cualquier versión

Compatibilidad con las plataformas

  • Windows
  • macOS
  • Linux
Versión Publicado Notas de la versión Action
2.1.0

Updated functions GetRPData and GetRPData_Outer to reflect changes in KEGG. Added a new example data set.

Descargar
1.4.0

Fixed the error in OrganismFindGUI caused by a naming ambiguity in KEGG.
Added updated code for faster database generation and network layouts.

Descargar
1.3.0

2 new functionalities: edges linked to corresponding KEGG reaction pair web page, text edit option to change a specific string (e.g. 'hydroxy' to 'OH') for all nodes simultaneously. Search functions for selecting organisms/metabolites were updated.

Descargar
1.2.0

Fixed 2 errors in subfunctions of MetaboGetworks, added function descriptions of input and output variables.

Descargar
1.1.0

Removal of a parfor in the TextMatch code.

Descargar
1.0.0

Descargar