Simsape Multibodyの座標系は相対座標系という考え方でモデル化さているため、Revolute Jointの回転軸を移動させる場合は、もともとどことどこの間にRevolute Jointが挿入されていたかを意識する必要があります。
全体の座標系を見渡すといろいろと方法がありますが。単純にRevolute Jointの位置だけ変えたいという場合は、次の方法がおすすめです。
相対座標系では、ツリーの根元を変えてしまうと、その先全体に影響が伝搬してしまうので、移動した分を、同じ座標返還ブロックを逆向き（FtoB)に挿入して、元に戻すと比較的簡単にRevolute Jointだけを移動できます。
