グレースケール行列の三次元イメージ表現

三次元行列をグラフィック表示するやり方が分かりません。 100×100×100doubleの三次元行列を作ったのですが、何か関数とかあるのでしょうか。それか二次元行列をスタックさせて三次元にするやり方でもあれば教えていただきたいです。 グレースケールの立方体で、中も色があるのでも大丈夫です。

例として100×100の行列のイメージ画像を添付します。これを三次元にしてそこから密度計算をしたいと考えてます。　

[Rena Berman]

(Answers dev) Rough translation

question: Three-dimensional image representation of gray scale matrix

body: I do not know how to graphically display three-dimensional matrices. I made a three-dimensional matrix of 100 × 100 × 100 double, but is there something like a function? Or I would like to tell you how to stack a two-dimensional matrix into three dimensions. It is a gray scale cube and it's okay to have color inside.

I attach an image image of a 100 × 100 matrix as an example. I think that I want to make this three-dimensional and calculate density from there.

[Yoshio]

こちらに例題がありますので、参考になるかと思います。slice表示なので、御要望に沿っていないかもしれませんが。 http://jp.mathworks.com/help/matlab/examples/manipulating-multidimensional-arrays.html?s_tid=gn_loc_drop

Answer 1

[michio]

70枚程度あるスライス画像を重ねて三次元表現する方法

上記エントリーにも記載（サンプルコード付き）がありますが、 isosurface関数 はお持ちのデータの可視化に使えますか？

「密度計算」については、ここでの密度の定義がわかっていませんが、こちらは表示とはまた別の問題でしょうか。

[thuru]

回答ありがとうございます。isosurface関数についてよくわかっていなく、やってみても三次元とはなりませんでした。 100×100×100のグレースケールの立方体が作れたらいいのですが、、

密度計算に関しては、三次元表示させたうえでグレースケールの体積のの密度計算です。

[michio]

グレースケースの画像をスタックした３次元データの等値面を表示することで３次元構造を可視化するようなイメージかと考え isosurface 関数を紹介しましたが、どうも異なるようですね？

グレースケールの立方体を作るというのは、例えば立方体の計６面の表面だけが表示できればよいですか？

意外と直接使える関数が見つかりませんでしたが・・

スライス平面を使用してボリューム データを表示する

の例の様に、グレースケール画像を表示する面を明示的に立方体の境界に指定して、立方体を形成することはできます（イメージ図添付しました）100x100x100のデータが I3D で定義されると仮定すると

h = slice(double(I3D),[1,100],[1,100],[1,100])
h(1).EdgeColor = 'none';
h(2).EdgeColor = 'none';
h(3).EdgeColor = 'none';
h(4).EdgeColor = 'none';
h(5).EdgeColor = 'none';
h(6).EdgeColor = 'none';

あくまでご質問からの類推ですが、、いかがでしょう。

[thuru]

確かに回答者様のおっしゃる通りだとisosurface関数も利用できるみたいですね！！挑戦してみます。

ありがとうございます！この方法は見つけられませんでした、、立体表現できてるのでこれは使えると思います。 半透明にして、グレースケールの密度も計算できたらよいのですが、

[michio]

どうしても私の想像力が足りず申し訳ありませんが、もう少し課題を具体的なものに落とし込む事が必要かと感じます。そもそも何を半透明にするのでしょう。

例えば100x100x100 のデータ内でなんとなく色の濃いところだけが表示される様な立体表示をイメージされているのか。そうすると上の立方体上の図は用途に叶いませんし。。もし最終的なイメージ図があれば解決策も考えやすいですし、他の閲覧者ともシンプルにやりとりができ、いろんな人が助けてくれると思いますよ。

もう一点、グレースケールの体積や密度というのは、なんでしょう。ある程度の明るさを持った部分の合計体積やそれが全体を占める割合といったイメージでしょうか？そうすると、その「ある程度」の値が決まっている場合には、100x100x100 の合計 1x10^6 点の中から、その値以上（もしくは以下）の値を持つデータ点の数を数えるだけでよく、立体表示する必要は必ずしもないような気もします。

[thuru]

説明がいろいろ不足していまして申し訳ございません。 立体表現する意味に関しまして、今回質問したデータは自分で決めた行列で、これを用いて指定した立体範囲内のエントロピー（黒が集まっていれば集まっているほど高い）や密度（黒であればあるほど高い）が得られる式を考えて自分で考えた行列なのでその式の正確性が分かります。そこで、最終的な目的として、医療機器で撮影して得られた三次元画像にその式を適用してエントロピーや密度を計算したいと考えています。

画像内で考えたほうが、指定する範囲などが分かりやすいので、今回三次元表示することを考えました。