imregconfig

Configuraciones para un registro basado en la intensidad

Sintaxis

[optimizer,metric] = imregconfig(modality)

Descripción

[optimizer,metric] = imregconfig(modality) crea las configuraciones optimizer y metric que pasa a imregister para realizar un registro de imagen basado en la intensidad, donde modality especifica la modalidad de captura de la imagen.

Ejemplos

Crear un optimizador y una métrica para registrar imágenes monomodales

Cargue las imágenes en el espacio de trabajo y muéstrelas. Estas imágenes son monomodales porque tienen un brillo y contraste similares.

fixed  = imread('pout.tif');
moving = imrotate(fixed, 5, 'bilinear', 'crop');
imshowpair(fixed, moving,'Scaling','joint')

Cree el optimizador y la métrica, estableciendo la modalidad en 'monomodal'.

[optimizer, metric]  = imregconfig('monomodal')

optimizer = 
  registration.optimizer.RegularStepGradientDescent

  Properties:
    GradientMagnitudeTolerance: 1.000000e-04
             MinimumStepLength: 1.000000e-05
             MaximumStepLength: 6.250000e-02
             MaximumIterations: 100
              RelaxationFactor: 5.000000e-01

metric = 
  registration.metric.MeanSquares

  This class has no properties.

Pase el optimizador y la métrica a imregister para realizar el registro.

movingRegistered = imregister(moving,fixed,'rigid',optimizer, metric);

Visualice las imágenes registradas

figure
imshowpair(fixed, movingRegistered,'Scaling','joint')

Registrar imágenes de RM multimodales con un optimizador

Lea dos imágenes. En este ejemplo se utilizan dos imágenes de resonancia magnética (RM) de una rodilla. La imagen fija es una imagen con eco de espín, mientras que la imagen en movimiento es una imagen con eco de espín con recuperación de inversión. Los dos cortes sagitales se obtuvieron al mismo tiempo, pero están ligeramente desalineados.

fixed = dicomread("knee1.dcm");
moving = dicomread("knee2.dcm");

Visualice las imágenes desalineadas.

imshowpair(fixed,moving,"Scaling","joint")

Cree el optimizador y la métrica, especificando la modalidad como "multimodal", dado que las imágenes proceden de diferentes sensores.

[optimizer,metric] = imregconfig("multimodal")

optimizer = 
  registration.optimizer.OnePlusOneEvolutionary

  Properties:
         GrowthFactor: 1.050000e+00
              Epsilon: 1.500000e-06
        InitialRadius: 6.250000e-03
    MaximumIterations: 100

metric = 
  registration.metric.MattesMutualInformation

  Properties:
    NumberOfSpatialSamples: 500
     NumberOfHistogramBins: 50
              UseAllPixels: 1

Ajuste las propiedades del optimizador para conseguir que el problema converja en unos máximos globales y que permita más iteraciones.

optimizer.InitialRadius = 0.009;
optimizer.Epsilon = 1.5e-4;
optimizer.GrowthFactor = 1.01;
optimizer.MaximumIterations = 300;

Realice el registro.

movingRegistered = imregister(moving,fixed,"affine",optimizer,metric);

Visualice las imágenes registradas.

imshowpair(fixed,movingRegistered,"Scaling","joint")

Argumentos de entrada

modality — Modalidad de captura de la imagen

"monomodal" | "multimodal"

Modalidad de captura de la imagen, especificada como uno de estos valores:

Modalidad	Descripción
"monomodal"	Las imágenes monomodales tienen un brillo y contraste similares. Las imágenes se capturan con el mismo tipo de escáner o sensor.
"multimodal"	Las imágenes multimodales tienen un brillo y contraste diferentes. Las imágenes pueden proceder de dos tipos distintos de dispositivo, como dos modelos de cámara o dos tipos de modalidades de captura de imágenes médicas (como un TAC o una RM). Las imágenes también pueden proceder de un solo dispositivo, como una cámara que utiliza diferentes ajustes de exposición o un escáner de resonancia magnética que utiliza diferentes secuencias de captura de imágenes.

Tipos de datos: char | string

Argumentos de salida

optimizer — Configuración de la optimización

Objeto optimizador RegularStepGradientDescent o OnePlusOneEvolutionary

Configuración de la optimización, devuelta como un objeto optimizador RegularStepGradientDescent o OnePlusOneEvolutionary.

metric — Configuración de la métrica

Objeto métrico MeanSquares o MattesMutualInformation

La configuración de la métrica describe la métrica de similitud de la imagen que se desea optimizar durante el registro, devuelta como un objeto métrico MeanSquares o MattesMutualInformation.

Sugerencias

• imregconfig devuelve optimizer y metric con la configuración predeterminada para proporcionar una configuración básica del registro. Si se ajustan las propiedades del optimizador o de la métrica, los resultados del registro pueden mejorar. Por ejemplo, si aumenta el número de iteraciones del optimizador, reduce el tamaño de paso del optimizador o cambia el número de muestras en una métrica estocástica, el registro mejora hasta cierto punto, a costa del rendimiento.

Capacidades ampliadas

Entorno basado en subprocesos

Ejecute código en segundo plano con MATLAB® backgroundPool o acelere código con Parallel Computing Toolbox™ ThreadPool.

Esta función es totalmente compatible con los entornos basados en hilos. Para obtener más información, consulte Run MATLAB Functions in Thread-Based Environment.

Historial de versiones

Introducido en R2012a

R2021b: Compatibilidad con entornos basados en hilos

Ahora imregconfig es compatible con los entornos basados en hilos.

Consulte también

Apps

• Registration Estimator

Funciones

• imshowpair | imregister

Objetos

• MattesMutualInformation | MeanSquares | RegularStepGradientDescent | OnePlusOneEvolutionary

Temas

• Create an Optimizer and Metric for Intensity-Based Image Registration
• Intensity-Based Automatic Image Registration

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