Procesamiento de imágenes volumétricas 3D

Filtre y segmente datos volumétricos 3D y aplique otras operaciones de procesamiento de imágenes

Realice operaciones de píxeles, filtrado local, operaciones morfológicas y otras operaciones de procesamiento de imágenes a conjuntos de datos 3D.

Apps

Volume Viewer	Visualizar datos volumétricos y datos volumétricos etiquetados
Volume Segmenter	Segment 3-D grayscale or RGB volumetric images

`volshow`	Display volume
`sliceViewer`	Browse image slices
`orthosliceViewer`	Browse orthogonal slices in grayscale or RGB volume
`obliqueslice`	Extract oblique slice from 3-D volumetric data
`viewer3d`	Create 3-D viewer object
Viewer3D Properties	Display scene in 3-D viewer
Volume Properties	Display volume in 3-D viewer
`Surface`	Display surface in 3-D viewer

`adaptthresh`	Umbral adaptativo de la imagen utilizando estadísticas locales de primer orden
`dicomread`	Leer una imagen DICOM
`dicomreadVolume`	Create 4-D volume from set of DICOM images
`dicomContours`	Extract ROI data from DICOM-RT structure set
`imbinarize`	Binarizar una imagen 2D en escala de grises o un volumen 3D por medio del método del valor umbral
`niftiinfo`	Leer los metadatos de un archivo NIfTI
`niftiwrite`	Escribir un volumen en un archivo usando el formato NifTI
`niftiread`	Leer una imagen NIfTI
`tiffreadVolume`	Read volume or time series image stack from TIFF file

`imabsdiff`	Diferencia absoluta de dos imágenes
`imadd`	Sumar dos imágenes o una constante a una imagen
`imdivide`	Dividir una imagen entre otra o dividir una imagen por una constante
`immultiply`	Multiplicar dos imágenes o multiplicar una imagen por una constante
`imsubtract`	Restar una imagen de otra o restar una constante de una imagen

`affinetform3d`	3-D affine geometric transformation
`imcrop3`	Crop 3-D image
`imref3d`	Reference 3-D image to world coordinates
`imregister`	Registro de imagen basado en la intensidad
`imregdemons`	Estimate displacement field that aligns two 2-D or 3-D images
`imresize3`	Cambiar el tamaño de imágenes volumétricas 3D de intensidad
`imrotate3`	Rotate 3-D volumetric grayscale image
`imwarp`	Aplicar la transformación geométrica a una imagen
`rigidtform3d`	3-D rigid geometric transformation
`simtform3d`	3-D similarity geometric transformation
`transltform3d`	3-D translation geometric transformation
`transformPointsForward`	Apply forward geometric transformation
`transformPointsInverse`	Apply inverse geometric transformation

`fibermetric`	Enhance elongated or tubular structures in image using Frangi vesselness filter
`fspecial3`	Create predefined 3-D filter
`histeq`	Mejorar el contraste mediante la ecualización de histogramas
`imadjustn`	Adjust intensity values in N-D volumetric image
`imboxfilt3`	3-D box filtering of 3-D images
`imfilter`	Filtrado multidimensional de imágenes multidimensionales
`imgaussfilt3`	Filtrado gaussiano 3D de imágenes 3D
`imhistmatchn`	Adjust histogram of N-D image to match histogram of reference image
`imnoise`	Añadir ruido a una imagen
`integralBoxFilter3`	3-D box filtering of 3-D integral images
`integralImage3`	Calculate 3-D integral image
`medfilt3`	Filtrado de mediana de 3D

`bwareaopen`	Eliminar objetos pequeños de una imagen binaria
`bwconncomp`	Buscar y contar los componentes conectados de una imagen binaria
`bwmorph3`	Morphological operations on binary volume
`bwskel`	Reducir todos los objetos a líneas en una imagen 2D binaria o un volumen 3D binario
`imbothat`	Filtrado con bottom-hat
`imclose`	Cerrar morfológicamente imágenes
`imdilate`	Dilatar una imagen
`imerode`	Erosionar una imagen
`imopen`	Apertura morfológica de imágenes
`imreconstruct`	Reconstrucción morfológica
`imregionalmax`	Máximos regionales
`imregionalmin`	Mínimos regionales
`imtophat`	Filtrado top-hat
`offsetstrel`	Elemento estructurante morfológico con desplazamiento
`strel`	Elemento estructurante morfológico
`watershed`	Transformada de watershed

`activecontour`	Segment image into foreground and background using active contours (snakes) region growing technique
`bfscore`	Contour matching score for image segmentation
`dice`	Coeficiente de similitud de Sørensen-Dice para segmentación de imágenes
`gradientweight`	Calculate weights for image pixels based on image gradient
`graydiffweight`	Calculate weights for image pixels based on grayscale intensity difference
`imsegfmm`	Binary image segmentation using fast marching method
`imsegkmeans3`	K-means clustering based volume segmentation
`jaccard`	Jaccard similarity coefficient for image segmentation
`superpixels3`	3-D superpixel oversegmentation of 3-D image

`bwselect3`	Select objects in binary volume
`edge3`	Find edges in 3-D grayscale volume
`imgradient3`	Find gradient magnitude and direction of 3-D image
`imgradientxyz`	Find directional gradients of 3-D image
`imhist`	Histograma de datos de imagen
`regionprops3`	Measure properties of 3-D volumetric image regions

`randomPatchExtractionDatastore`	Datastore for extracting random 2-D or 3-D random patches from images or pixel label images
`centerCropWindow3d`	Create cuboidal center cropping window
`randomCropWindow3d`	Create randomized cuboidal cropping window
`randomAffine3d`	Create randomized 3-D affine transformation
`affineOutputView`	Create output view for warping images

Explore 3-D Volumetric Data with Volume Viewer App
View perpendicular cross-sections of 3-D volumetric data and adjust the rendering to reveal structures within the volume.
Explore 3-D Labeled Volumetric Data with Volume Viewer
View 3-D labeled volumetric data, and adjust the visualization such as the opacity and colormap, using the Volume Viewer app.
Display Interior Labels by Clipping Volume Planes
Interactively clip a quadrant of a volumetric image to expose a surface within the volume.
Display Interior Labels by Adjusting Volume Overlay Properties
Adjust the transparency of labeled volumetric data and the rendering style to reveal labels on the interior of the volume.

Create Binary Mask Using Volume Segmenter
This example shows how to segment a volume in the Volume Segmenter app.
Work with Blocked Images Using Volume Segmenter
Segment a volumetric image that could be too large to fit into memory by converting the volume to a blocked image.
Compute 3-D Superpixels of Input Volumetric Intensity Image
Convert 3-D MRI data into a grayscale intensity image of superpixels.
Preprocess Volumes for Deep Learning (Deep Learning Toolbox)
Read and preprocess volumetric image and label data for 3-D deep learning.

Align two volumetric images using automatic intensity-based image registration.

Perform a 3-D segmentation using active contours (snakes) and view the results using the Volume Viewer app.

Perform semantic segmentation of brain tumors from 3-D medical images.